自理報關(guān)是指由進出口貨物收發(fā)人自行辦理報關(guān)業(yè)務(wù)，根據(jù)我國海關(guān)目前的規(guī)定，進出口收發(fā)貨人必須依法向海關(guān)注冊登記后才能辦理報關(guān)業(yè)務(wù)。

總的來說，自理報關(guān)企業(yè)需要進行網(wǎng)上錄入、申報、查詢、打印報關(guān)單，以及網(wǎng)上查詢海關(guān)回執(zhí)等操作。

1、自理報關(guān)單位錄入業(yè)務(wù)流程：

(1)自理報關(guān)單位持“報關(guān)單錄入”操作員卡的操作員進入中國電子口岸“報關(guān)單錄入”界面，可先下載本企業(yè)征免稅證明、加工貿(mào)易手冊或加工區(qū)備案清單后，脫機錄入報關(guān)單數(shù)據(jù)(數(shù)據(jù)暫存在本地數(shù)據(jù)庫);

(2)錄入并提交后將錄入的報關(guān)單數(shù)據(jù)信息上載到數(shù)據(jù)中心，進入自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程;

2、自理報關(guān)審核申報業(yè)務(wù)流程：

自理報關(guān)單位持“報關(guān)單審核申報”操作員卡的操作員進入中國電子口岸的“報關(guān)單審核申報”界面，對報關(guān)單的邏輯性、填報的規(guī)范性進行審核，確保報關(guān)單可以向海關(guān)進行申報。

若審核不通過，則需要將報關(guān)單下載到本地進行修改，修改后的報關(guān)單需重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且需要重新進行審核。

審核通過后進入自理報關(guān)申報確認業(yè)務(wù)流程;

3、自理報關(guān)申報確認業(yè)務(wù)流程：

(1)自理報關(guān)單位持“報關(guān)單申報確認”操作員卡的企業(yè)管理人員進入中國電子口岸“報關(guān)單申報確認”界面，對報關(guān)單進行確認申報操作，經(jīng)“申報確認”后的報關(guān)單通過公共數(shù)據(jù)中心傳到海關(guān)內(nèi)部網(wǎng)。

如果申報確認時認為報關(guān)單的填制不符合邏輯，需要將報關(guān)單數(shù)據(jù)下載到本地進行修改，修改完畢之后需要將數(shù)據(jù)重新上載到數(shù)據(jù)中心，并且重新進行審核和申報確認。

(2)自理報關(guān)單位打印出經(jīng)海關(guān)審核通過的報關(guān)單，并攜帶其他單證去海關(guān)辦理其他通關(guān)手續(xù)。

代理報關(guān)業(yè)務(wù)流程：

進出口商向海關(guān)報關(guān)時，需提交以下單證：進出口貨物報關(guān)單。一般進口貨物應(yīng)填寫一式二份；需要由海關(guān)核銷的貨物，如加工貿(mào)易貨物和保稅貨物等，應(yīng)填寫專用報關(guān)單一式三份；貨物出口后需國內(nèi)退稅的，應(yīng)另填一份退稅專用報關(guān)單。

貨物發(fā)票。要求份數(shù)比報關(guān)單少一份，對貨物出口委托國外銷售，結(jié)算方式是待貨物銷售后按實銷金額向出口單位結(jié)匯的，出口報關(guān)時可準予免交。

陸運單、空運單和海運進口的提貨單及海運出口的裝貨單。海關(guān)在審單和驗貨后，在正本貨運單上簽章放行退還報關(guān)貢，憑此提貨或裝運貨物。

貨物裝箱單。其份數(shù)同發(fā)票。但是散裝貨物或單一品種且包裝內(nèi)容一致的件裝貨物可免交。

出口收匯核銷單。一切出口貨物報關(guān)時，應(yīng)交驗外匯管理部門加蓋"監(jiān)督收匯"章的出口收匯核銷單，并將核銷編號填在每張出口報關(guān)單的右上角處。

海關(guān)認為必要時，還應(yīng)交驗貿(mào)易合同、貨物產(chǎn)地證書等。

其它有關(guān)單證：

（1）經(jīng)海關(guān)批準準予減稅、免稅的貨物，應(yīng)交海關(guān)簽章的減免稅證明，北京地區(qū)的外資企業(yè)需另交驗海關(guān)核發(fā)的進口設(shè)備清單；

（2）已向海關(guān)備案的加工貿(mào)易合同進出口的貨物，應(yīng)交驗海關(guān)核發(fā)的"登記手冊"。

代理報關(guān)是相對于自理報關(guān)來說的，兩者都是針對進出口貨物報關(guān)來講的。

代理報關(guān)又分為直接代理報關(guān)和間接代理報關(guān)。

直接代理報關(guān)是指報關(guān)企業(yè)接受委托人的委托，以委托人的名義辦理報關(guān)業(yè)務(wù)的行為。

間接代理報關(guān)是指報關(guān)企業(yè)接受委托人的委托，以報關(guān)企業(yè)自身的名義向海關(guān)辦理報關(guān)業(yè)務(wù)的行為。

有權(quán)辦理代理報關(guān)的企業(yè)應(yīng)具備的資格：取得報關(guān)企業(yè)注冊登記許可在海關(guān)注冊登記。

自理報關(guān)與代理報關(guān)的區(qū)別：

自理報關(guān)：假如你公司有自營進出口權(quán)，并且在海關(guān)有注冊登記，另外你公司有自己的報關(guān)員，那么報關(guān)員就可以自行前往海關(guān)報關(guān)。

代理報關(guān)：如果你公司有自營進出口權(quán)，并且在海關(guān)有注冊登記，但是你公司沒有自己的報關(guān)員，那么你公司就需要委托其他擁有報關(guān)資質(zhì)的專業(yè)報關(guān)公司(報關(guān)行)代理報關(guān)，一般都是以貴司的名義去向海關(guān)申報，只不過去報關(guān)的是報關(guān)行的報關(guān)員，你需要支付代理報關(guān)費。